В статье рассматривается социальная история молекулярной биологии в Советском Союзе в 1950-х – первой половине 1960-х гг., в период, когда эта новая дисциплина находилась в СССР в процессе становления. На основе изучения архивных материалов Института молекулярной биологии, фонда В. А. Энгельгардта в Архиве РАН, протоколов заседания Президиума АН СССР, воспоминаний современников, материалов постановлений по Академии наук Политбюро ЦК РКП(б) – ВКП(б) – ЦК КПСС рассмотрены влияние на этот процесс политико-экономической ситуации в СССР и особенности институционализации новой науки. Проанализированы факторы, которые стали причинами различий в историческом пути молекулярной биологии в СССР и на Западе. Отмечено, что главным среди них было длительное господство в советской биологии Т. Д. Лысенко и его идей, из-за чего резко уменьшилось количество исследователей, потенциально способных заниматься молекулярно-биологическими исследованиями, и возникли трудности для институционализации этих исследований. Последнее видно на примере сложной истории организации Института молекулярной биологии АН СССР, вынужденного первые годы своего существования именоваться Институтом радиационной и физико-химической биологии АН СССР, поскольку радиационные и физические исследования были свободны от лысенкоистской критики и могли служить прикрытием для молекулярно-биологических исследований. Отмечается, что преодоление последствий реакции в биологии и ее возрождение происходили при поддержке Академии наук в лице ее действительных членов А. Н. Несмеянова, Н. Н. Семенова, И. В. Курчатова, М. М. Шемякина, П. Л. Капицы, В. А. Энгельгардта.