В статье рассмотрена судьба генетика и селекционера А. А. Сапегина (1883–1946), академика АН УССР, коллеги и единомышленника Н. И. Вавилова, пропагандиста научной селекции, опирающейся на новейшие достижения генетики. На созданной Сапегиным Одесской селекционной станции, а затем и в Украинском генетико-селекционном институте, на кафедре генетики, в учебниках, автором которых он являлся, в лекциях он первым в России последовательно проводил идею о том, что законы наследственности должны лежать в основе селекции сельскохозяйственных растений. Сапегин одним из первых применил рентгеновские лучи для получения искусственных мутаций у растений. Вавилов, высоко оценивая работы Сапегина, сделал его своим заместителем во вновь организованном Институте генетики АН СССР. В статье с использованием материалов переписки проанализированы контакты двух ученых. Научная биография Сапегина рассмотрена в контексте исторических событий, происходивших в отечественной биологии и во всей академической науке, которые затормозили развитие генетики и селекции в нашей стране. На примере Института генетики с использованием архивных материалов прослежены нападки на фундаментальные исследования, как не дающие немедленного практического результата. В статье показаны вся сложность ситуация, в которой Сапегин оказался в качестве заместителя директора Института генетики, и его попытки противостоять лысенковской биологии и наступлению на генетику. Подробно рассмотрены дискуссии, которые проводились при проверке деятельности института и позиция ряда ученых. Отвергая упреки в приверженности института к лженаучным теориям и отсутствии полноценной научной теории селекции, Сапегин предложил экспериментально проверить опыты Лысенко, и соответствующие работы были проведены по распоряжению АН СССР, что, однако, не изменило хода событий.